251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7199 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  100 
 
 
278 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.36 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  28.03 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  32.18 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  24.21 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  31.02 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  37.76 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  28.26 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  32.19 
 
 
217 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  24.88 
 
 
242 aa  58.9  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  31.13 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  31.13 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  31.13 
 
 
431 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.84 
 
 
234 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.05 
 
 
346 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
272 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
853 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.47 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  28.72 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0932  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  33.62 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.312872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  28.91 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.45 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
186 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
187 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  30.09 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
190 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.78 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  28.4 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  26.51 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.55 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
284 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 
233 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
209 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  51.02 
 
 
145 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.03 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.06 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  30.83 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
173 aa  49.7  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
409 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
191 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>