100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6995 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  100 
 
 
224 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  58.33 
 
 
228 aa  269  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  30.67 
 
 
228 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
242 aa  95.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  28.42 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  28.42 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  28.42 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  28.42 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  28.42 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  30 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  27.37 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  28.95 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  27.89 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  27.89 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  27.89 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  28.42 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  28.38 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  26.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  26.84 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  26.84 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  26.58 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  25.88 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  25.88 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  25.7 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  25.66 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  26.22 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  24.06 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  25.65 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  24.77 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  27.31 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  24.77 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  25.12 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  27.98 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  24.77 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  24.2 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  24.06 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  26.46 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  26.7 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  31.87 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  25 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  25.43 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  25.43 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  24.89 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  27.96 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  25.66 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  26.19 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  26.24 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  22.32 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  26.41 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  24.14 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  25 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  25 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  29.37 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  25 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  26.39 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  29.37 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.4 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  21.86 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  26.43 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  26.42 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  24.77 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  23.37 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  24.77 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  30 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  24.3 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  25 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
276 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  23.38 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  24.77 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  24.53 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  25 
 
 
288 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  26.97 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  25.32 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  26.32 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  21.92 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  22.83 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  23.15 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  27.1 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 
329 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  22.98 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.29 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.1 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  25.43 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  27.97 
 
 
310 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
201 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.32 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>