More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0491 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
288 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  32.44 
 
 
282 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
274 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
278 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
264 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  28.33 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  31.02 
 
 
370 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  31.02 
 
 
438 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  31.02 
 
 
431 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  25.21 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  24.79 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  30.95 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.71 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  32.28 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 
145 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  27.5 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
272 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.03 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  30.25 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.19 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  29.58 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  30 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
269 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  26.94 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  27.09 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  30 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04931  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 
233 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.623643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  33.06 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
233 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
264 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.6 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.79 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.75 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  30 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
415 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04841  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.25 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 
853 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1762  demethylmenaquinone methyltransferase  28.3 
 
 
232 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.94 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04551  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.3 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.75 
 
 
287 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
369 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
624 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.54 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  42.25 
 
 
349 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  29.51 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.45 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  45.1 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.54 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
210 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.22 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  31.75 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04861  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.25 
 
 
233 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.020806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>