176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5566 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  44.57 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  41.5 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 		 853 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  38.06 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.1 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  44.62 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  23.24 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  23.65 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  26.75 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  32.9 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.81 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2726  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 82 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.607127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.37 
 
 		 168 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.61 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  28.97 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.86 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1022  Methyltransferase type 12  44.12 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.53 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.33 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  35.34 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  28.24 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 357 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5453  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  35 
 
 		 389 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  35.04 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  25.58 
 
 		 524 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1147  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.46 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.81 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.56 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.84 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.48 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3720  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  24.53 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.82 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.27 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3803  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.23 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  25.74 
 
 		 343 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  27.22 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2269  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.83 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3662  methyltransferase  34.65 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4129  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0406276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  24.2 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.2 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.25 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.6 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2436  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.92 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  31.62 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.23 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  32.28 
 
 		 658 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  24.07 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>