107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2754 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  32.13 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  27.49 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.91 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.65 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  27.14 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  24.62 
 
 
524 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  23.32 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  26.87 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  30.58 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  24.1 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  28.33 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 
288 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.09 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  26.78 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  23.49 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  39.58 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.34 
 
 
273 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
624 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.26 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.31 
 
 
374 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.06 
 
 
362 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  31.5 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
1162 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 
853 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.6 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1366  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0509799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  45.05 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  24.14 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  28.7 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  26.71 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.43 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  29.91 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.73 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.19 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  29.17 
 
 
370 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.2 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.57 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  30.19 
 
 
438 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  23.42 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  22.58 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.38 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30.5 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  30.19 
 
 
431 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.15 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  34.51 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  22.96 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.36 
 
 
287 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  27.01 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
996 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.78 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.23 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
519 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>