31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2103 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  85.85 
 
 
205 aa  358  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  53.73 
 
 
206 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 
207 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  52.5 
 
 
223 aa  201  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  52.26 
 
 
294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  53 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  49.75 
 
 
204 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  50.25 
 
 
205 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  53.61 
 
 
194 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 
209 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  45.5 
 
 
206 aa  187  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  45.15 
 
 
207 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  40.3 
 
 
206 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  51.79 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  47.72 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  47.72 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  48.98 
 
 
205 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  48.26 
 
 
204 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  43.54 
 
 
210 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  28.76 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  25.69 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 
260 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  33.03 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  32.31 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.72 
 
 
213 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>