52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2423 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  62.56 
 
 
206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  62.56 
 
 
205 aa  257  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  55.61 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  56.72 
 
 
204 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  53.99 
 
 
294 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  56.5 
 
 
204 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  49.24 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  49.24 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  51.96 
 
 
206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  51 
 
 
207 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  47.34 
 
 
209 aa  205  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  52.5 
 
 
205 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  51.49 
 
 
205 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  50.49 
 
 
206 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  50.77 
 
 
194 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  43.35 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  39.3 
 
 
206 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  45.1 
 
 
210 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  48.17 
 
 
209 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  30.15 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  25.66 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28.19 
 
 
235 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  22.03 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  34.75 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  23.63 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  18.31 
 
 
209 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  26.09 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  20.13 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  30.87 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  25.36 
 
 
318 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  23.15 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  28.18 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  23.7 
 
 
315 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  23.15 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  27.93 
 
 
315 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
210 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
210 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  25.45 
 
 
265 aa  42  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  33.58 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  28.12 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>