237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7716 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  36.72 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  37.23 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  34.06 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 1001 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  36.09 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  37.6 
 
 		 462 aa  71.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  31.78 
 
 		 464 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  30.28 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  29.69 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  29.92 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  29.69 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  28.85 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  28.35 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  29.13 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  28.24 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  29.53 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.9 
 
 		 7541 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 1015 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  31.43 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.91 
 
 		 2012 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.13 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  27.82 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  31.3 
 
 		 4090 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.63 
 
 		 2867 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  27.56 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.56 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 335 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.54 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.68 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.68 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  29.51 
 
 		 524 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.56 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.56 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 491 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  33.06 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  28.91 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  32.08 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.56 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  26.39 
 
 		 398 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  32 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.04 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  28.21 
 
 		 6999 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.21 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.62 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.68 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.46 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.74 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  32.18 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 303 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.14 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  32.76 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.84 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 337 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.52 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 348 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  24.37 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>