196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4156 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  95.96 
 
 		 198 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  81.12 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  60.51 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  53.68 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  48.42 
 
 		 192 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  42.63 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  46.84 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  46.6 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  44.33 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  47.27 
 
 		 464 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  42.33 
 
 		 462 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  45.7 
 
 		 471 aa  134  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  40.96 
 
 		 447 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  40.84 
 
 		 502 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  43.26 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  35.45 
 
 		 208 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  41.88 
 
 		 464 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  35.45 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  43.17 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  38.19 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  35.71 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  40.97 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  39.58 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.12 
 
 		 708 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  36.73 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  35.71 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  38.86 
 
 		 427 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  31.77 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 		 1001 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  31.4 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  38.79 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 		 1015 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  36.31 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  36.31 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.2 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1171 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  30.06 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 269 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  34 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  27.64 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0598  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 		 265 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  33.04 
 
 		 261 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 269 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  34.43 
 
 		 338 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  20.91 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.87 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.95 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.89 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  27.68 
 
 		 2997 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  32.67 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0913  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.45 
 
 		 407 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.03 
 
 		 541 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.89 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 349 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 		 329 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 282 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  27.5 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  29.41 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  32.99 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 302 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  32.99 
 
 		 265 aa  44.7  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  26.53 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  25.89 
 
 		 2012 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>