More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1837 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  86.87 
 
 		 272 aa  461  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  51.56 
 
 		 257 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  53.17 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  38.17 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  28.24 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.65 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  27.49 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  27.06 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  34.58 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.45 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 996 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.94 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.06 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.04 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.16 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  25.73 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.16 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.68 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  34.43 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 		 802 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.51 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.04 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  31.89 
 
 		 204 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.74 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4005  hypothetical protein  37 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.151604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.01 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30.99 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  31.02 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  32.52 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2266  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4151  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1888  hypothetical protein  29.08 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.61 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  24.21 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  34 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.08 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0559  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1038  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0997  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  31.93 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.86 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 689 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0339  hypothetical protein  26.02 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0688998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  24.22 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  30.64 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 276 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 206 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.19 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 247 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.4 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 		 1424 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0317965 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  26.44 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>