More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2952 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  44.67 
 
 
3432 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  44.97 
 
 
3470 aa  743    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  44.96 
 
 
4136 aa  762    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  47.2 
 
 
5596 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  42.86 
 
 
4317 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  48.54 
 
 
5953 aa  834    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  48.26 
 
 
6889 aa  838    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  41.54 
 
 
2581 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  42.38 
 
 
4336 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  41.56 
 
 
2571 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  42.99 
 
 
5213 aa  678    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  47.28 
 
 
2151 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  42.95 
 
 
4317 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  43.14 
 
 
3824 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  42.59 
 
 
1753 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  45.83 
 
 
3432 aa  802    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  47.33 
 
 
4531 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  44.92 
 
 
2845 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  38.17 
 
 
3639 aa  1060    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  43.12 
 
 
4383 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  43.14 
 
 
2395 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  39.07 
 
 
2156 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  41.56 
 
 
2571 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  44.91 
 
 
1193 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  43.3 
 
 
1370 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  42.16 
 
 
4336 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  39.2 
 
 
1550 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  47.42 
 
 
2154 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  45.89 
 
 
1578 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
2012 aa  4096    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  30.56 
 
 
1740 aa  704    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  48.16 
 
 
1839 aa  807    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.92 
 
 
13537 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  47.7 
 
 
6676 aa  809    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  39.17 
 
 
1127 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  40.47 
 
 
1556 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.7 
 
 
2867 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  45.48 
 
 
2791 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  39.4 
 
 
1142 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  49.59 
 
 
3308 aa  929    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  43.21 
 
 
3498 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  43.03 
 
 
2395 aa  740    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  42.06 
 
 
2033 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  41.77 
 
 
2193 aa  741    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  32.89 
 
 
4483 aa  861    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  39.07 
 
 
2156 aa  672    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  39.84 
 
 
1776 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  41.28 
 
 
6661 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  42.23 
 
 
6072 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  42.06 
 
 
4572 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  49.25 
 
 
3291 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  39.26 
 
 
1336 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  47.44 
 
 
4502 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  43.02 
 
 
4960 aa  761    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  33.91 
 
 
3099 aa  740    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  47.5 
 
 
4882 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  44.41 
 
 
2006 aa  806    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  44.66 
 
 
1369 aa  725    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  43.94 
 
 
4332 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  47.39 
 
 
2439 aa  772    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  40.58 
 
 
1556 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  42.99 
 
 
1110 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  43.03 
 
 
2664 aa  740    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  40.19 
 
 
7168 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  42.84 
 
 
4317 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  42.71 
 
 
4968 aa  772    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  46.48 
 
 
4489 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  40.83 
 
 
3235 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  40.67 
 
 
3086 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  44.91 
 
 
1193 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  39.07 
 
 
2156 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  50.81 
 
 
8646 aa  882    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  42.41 
 
 
7712 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  46.96 
 
 
2350 aa  762    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  50 
 
 
3176 aa  826    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.96 
 
 
4478 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  43.17 
 
 
4342 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  45.18 
 
 
5149 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.85 
 
 
2997 aa  1050    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  42.93 
 
 
2448 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  42.41 
 
 
4317 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  32.7 
 
 
7785 aa  789    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  40.59 
 
 
2419 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  43.33 
 
 
3018 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  42.9 
 
 
4960 aa  767    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  46.49 
 
 
3404 aa  760    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  43.64 
 
 
2370 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  37.17 
 
 
8211 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  37.55 
 
 
2752 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  47.58 
 
 
1769 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  35.49 
 
 
3761 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  45.02 
 
 
5328 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  37.6 
 
 
1833 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  41.08 
 
 
3086 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  47.1 
 
 
6403 aa  747    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  48.1 
 
 
4747 aa  806    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  43.17 
 
 
4342 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  41.59 
 
 
3291 aa  697    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  42.52 
 
 
6081 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  41.94 
 
 
4468 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>