182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 		 502 aa  987    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  44.9 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  43.72 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  43.18 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  41.04 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.49 
 
 		 708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  37.66 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  34.16 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  44.62 
 
 		 208 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  45.96 
 
 		 199 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  43.08 
 
 		 208 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  45.92 
 
 		 201 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  46.43 
 
 		 201 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  43.16 
 
 		 195 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  42.86 
 
 		 203 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 240 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  42.11 
 
 		 199 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  41.84 
 
 		 199 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  41.45 
 
 		 199 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  41.33 
 
 		 199 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  41.33 
 
 		 199 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  47.22 
 
 		 191 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  39.08 
 
 		 277 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  45.81 
 
 		 207 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  37.18 
 
 		 260 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 265 aa  136  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  40.43 
 
 		 197 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  39.89 
 
 		 192 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  36.22 
 
 		 192 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  40.84 
 
 		 198 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  34.02 
 
 		 197 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  40.31 
 
 		 198 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  35.36 
 
 		 255 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  33.47 
 
 		 257 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  34.83 
 
 		 252 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  40 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  26.97 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  33.88 
 
 		 251 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  33.88 
 
 		 257 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  33.46 
 
 		 251 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  34.62 
 
 		 250 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  41.05 
 
 		 197 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  34.87 
 
 		 251 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  30.45 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 202 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  31.8 
 
 		 264 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  31.3 
 
 		 244 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  31.28 
 
 		 261 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  38.78 
 
 		 234 aa  83.2  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  31.68 
 
 		 246 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  32.39 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  33.61 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  32.64 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  32.91 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  29.39 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  27.04 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 		 1015 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  27.08 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  30.88 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  32.81 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  37.29 
 
 		 190 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  22.47 
 
 		 265 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  30.29 
 
 		 245 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 1001 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.88 
 
 		 260 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 175 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  29.27 
 
 		 4483 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  44.59 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.55 
 
 		 193 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  34.04 
 
 		 693 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 252 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  36.73 
 
 		 239 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  27.84 
 
 		 300 aa  50.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  24.64 
 
 		 207 aa  50.4  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  23.2 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  40 
 
 		 189 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  34.04 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  32.52 
 
 		 6999 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 208 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1973  MCP methyltransferase, CheR-type  35.92 
 
 		 1137 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.32 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  26.94 
 
 		 3761 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.63 
 
 		 213 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  24.32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.95 
 
 		 250 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  24.3 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  27.42 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.32 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 249 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  35.16 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25.32 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  37.11 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25.32 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25.32 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  32.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 237 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>