296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0697 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  44.78 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  28.5 
 
 
302 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  32.11 
 
 
244 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  30.27 
 
 
286 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  37.8 
 
 
213 aa  89  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  35.92 
 
 
237 aa  87.8  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  31.5 
 
 
264 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  30 
 
 
447 aa  84.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  30.77 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.35 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  31.72 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  38.33 
 
 
270 aa  81.3  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  31.48 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  29.68 
 
 
265 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.17 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  34.13 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  30.69 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  30.16 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  29.63 
 
 
245 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.56 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.88 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  34.65 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  28.87 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  30.69 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  30.69 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.69 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  32.02 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  29.03 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.41 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.41 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  29.49 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.41 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  36.15 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  28.5 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  30 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  32.11 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.67 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.96 
 
 
237 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.35 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.16 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.72 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.26 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.57 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.96 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.87 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.57 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  27.23 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  28.79 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  29 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.74 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.23 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  28.38 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  32.37 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  36.15 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  28.18 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  29.26 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  27.88 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  25.65 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  32.82 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  31.95 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.03 
 
 
299 aa  65.1  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.43 
 
 
302 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  24.62 
 
 
225 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  32.76 
 
 
237 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  29.66 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  28.78 
 
 
234 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  29.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  27.66 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  31.41 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  33.83 
 
 
239 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  28.04 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  30.25 
 
 
274 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  37.93 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  39.5 
 
 
221 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.94 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  29.95 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  25.26 
 
 
240 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  28.27 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.96 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  32.84 
 
 
249 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  28.06 
 
 
244 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  24.38 
 
 
464 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.17 
 
 
308 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.03 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.03 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.03 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.03 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  27.66 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  30.77 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>