213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  38.55 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  39.22 
 
 		 223 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  39.22 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  39.22 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  39.22 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  38.73 
 
 		 223 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  45 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  39.41 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  43.17 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  41.46 
 
 		 233 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  37.86 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  35.48 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  34.7 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  32.71 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  32.73 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  28.64 
 
 		 207 aa  95.5  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  34.42 
 
 		 221 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  27.48 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  34.55 
 
 		 250 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.74 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.33 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  32.57 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.8 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  33.5 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  26.46 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.34 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  31.5 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  28.57 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.67 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.93 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  28.57 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  31.75 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  29.36 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  27.85 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  31.63 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  31.22 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  31.51 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  29.91 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.14 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.93 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  30.09 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  31.63 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  29.22 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  32.51 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  31.12 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.41 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  33.78 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  37.07 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  30.81 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  27.83 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  31.16 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  34.46 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  29.56 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  31.34 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26.09 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.23 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  29.06 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.06 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.75 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  29.82 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  28.25 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  37.35 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.64 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  25.33 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  26.23 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  31 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  30.93 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.4 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  28.32 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  33.79 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.07 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.67 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  35.66 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  34.11 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.98 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  31.91 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  26.27 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.89 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  32 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.17 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  29.31 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  24.06 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  25.74 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  26.27 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  25.21 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.41 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  30.96 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.1 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  27.92 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.17 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.29 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.17 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.17 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.17 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.17 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>