75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0783 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  80.18 
 
 		 217 aa  364  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  47.5 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  46.73 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  46.73 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  43.26 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  44.55 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  44.02 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  44.28 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  39.23 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  34.48 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  30.29 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.37 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  32.51 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  31.55 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  26.09 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  33.5 
 
 		 358 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  30.36 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.17 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  29.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  28.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.89 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.7 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.19 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  27.23 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  26.61 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  28.57 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.41 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.68 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  25.46 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.04 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  27.06 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.71 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  29.13 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  26.67 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  26.51 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  22.65 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.33 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  29.41 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  27.48 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.31 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  27.15 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  25.11 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  29.13 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  24.12 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  29.03 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  29.29 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  32.54 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  31.25 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  29.23 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.31 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  24.68 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.27 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.41 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.55 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  29.5 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  27.42 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  29.13 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  30.23 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  30.05 
 
 		 471 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.22 
 
 		 225 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.42 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  30.83 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.41 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  33.33 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>