73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0383 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  99.54 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  87.61 
 
 
218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  53.27 
 
 
208 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  52.5 
 
 
212 aa  204  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  46.73 
 
 
217 aa  188  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  43.96 
 
 
217 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  44.98 
 
 
235 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  45 
 
 
225 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  40.78 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  31.9 
 
 
302 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  28.3 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.63 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  26.57 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.7 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  29.35 
 
 
359 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.55 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.47 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.47 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.47 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  24.45 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
350 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  30.05 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  22.34 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  29.75 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  35.59 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  24.76 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  32.77 
 
 
358 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.58 
 
 
271 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  28.51 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  29.91 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  25.43 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  30.94 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  30.58 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  29.91 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.3 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  26.77 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  34.78 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  25.15 
 
 
252 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  29.41 
 
 
250 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  31.06 
 
 
247 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  31.97 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  28.46 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  32.77 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  30.65 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.74 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  25.12 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.32 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  30.33 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  31.15 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.25 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.64 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.15 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  25.12 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.57 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  29.45 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  31.02 
 
 
358 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  25.84 
 
 
292 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  23.45 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.43 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  30.43 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  29.03 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.97 
 
 
250 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.93 
 
 
270 aa  42  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  28 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  47.5 
 
 
266 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>