159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0634 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  52.97 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 350 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  41.26 
 
 		 358 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  39.41 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 359 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  33.98 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  38.12 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  34.67 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  39.49 
 
 		 358 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  39.27 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  35.98 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  33.64 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  36.81 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  34.15 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  34.15 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  34.15 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  34.15 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  34.27 
 
 		 210 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  33.66 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  34.1 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  27.98 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  29.95 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.37 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  28.37 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  29.07 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  31.13 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  29.11 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.95 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  30.37 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  28.57 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.51 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  32.87 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.82 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  28.19 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.94 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.75 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.32 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.91 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.95 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  28.38 
 
 		 242 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  30.94 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.67 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  26.34 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.84 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.31 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  30.29 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  31.22 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.24 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  29.52 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.11 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  26.11 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  29.36 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.79 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  25.45 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  26.99 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.95 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.89 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.96 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.2 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  29.83 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.17 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  30.77 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  30.28 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  27.85 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  31.71 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.88 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  28.31 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  22.28 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  35.17 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  23.85 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  28.88 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  27.96 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.68 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  29.19 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.78 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  26.2 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.96 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  23.56 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  29.17 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  26.7 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  27 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  27.27 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  30.15 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  24.88 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.31 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.89 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  30 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  25.11 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>