62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0637 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  58.04 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  56.42 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  44.28 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  45 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  45.5 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  45 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  38.18 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  42 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  39.71 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  25.47 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.58 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.58 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.58 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  26.58 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.13 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  27.62 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.96 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.19 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.83 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  25.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  29.96 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.29 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  36.8 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.9 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  32.59 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  32.65 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  27.51 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  34.43 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.36 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  30.86 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.89 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  28.91 
 
 		 358 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  28.28 
 
 		 569 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  29.41 
 
 		 471 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  28.24 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  26.2 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  37.17 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  23.35 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  30.52 
 
 		 447 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.83 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.52 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  31.62 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.57 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.92 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  24.62 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  23.89 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  36 
 
 		 358 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  24.84 
 
 		 286 aa  41.6  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.14 
 
 		 277 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>