251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1995 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  50.72 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  46.1 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  50.93 
 
 		 298 aa  254  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  50.36 
 
 		 272 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  49.64 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  47.81 
 
 		 277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  37.31 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  33.73 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  33.33 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  35.82 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.51 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.45 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  33.33 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  35.41 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.52 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  31.14 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  30.23 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  39.13 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  30.77 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.65 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.03 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.82 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.45 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  31.03 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  32.45 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31.31 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  30.43 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.57 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  29.5 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  29.3 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  29.3 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  29.3 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.45 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.68 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.5 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.03 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.34 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  27.27 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  29.63 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  27.69 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  31.34 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  30.32 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  34.01 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  31.73 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.03 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.41 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  29.47 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  26.24 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  33.49 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  26.7 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  31.22 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  30.69 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.15 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  37.12 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.98 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.32 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  29.44 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  29.84 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  31.38 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  27.64 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.79 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  31.68 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.6 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  29.29 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.58 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.66 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  30.73 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  28.95 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.84 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  29.06 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  29.17 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  29.77 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  28.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  27.23 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  29.77 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  28.14 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  31.06 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  28.75 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.89 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  29.77 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.81 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  30.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.96 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  29.69 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  30.53 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  30.37 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.31 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.67 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  36.36 
 
 		 427 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.52 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  24.19 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>