232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3083 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  55.6 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  52.94 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  52.3 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  51.46 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  50.83 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  49.58 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  48.74 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  48.96 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  41.88 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  41.25 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  39.5 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  38.66 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  38.46 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  37.66 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  40.43 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  40.25 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  40.43 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  38.29 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  39.42 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  39.74 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  39.74 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  40.17 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  38.43 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  40.17 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  37.23 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  36.86 
 
 		 225 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  33.61 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  33.05 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  34.43 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  29.75 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  32.65 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.84 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  30.29 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  33.33 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  33.51 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.27 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.61 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.32 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.22 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.62 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  27.87 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  26.16 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.23 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  27.44 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.73 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.12 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  29.44 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.77 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.84 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.54 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  33.11 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  26.4 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.88 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.65 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  25.78 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  30.67 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  29.17 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  33.17 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  27.04 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  32.81 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  28.09 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.14 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  27.2 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  27.2 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  27.2 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.78 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  28.1 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.38 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  30.73 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  29.84 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.12 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  28.23 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  32.79 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  26.78 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  28.1 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  29.32 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  26.25 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  27.27 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  28.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  27.08 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  27.39 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.76 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  26.56 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  29.02 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  23.18 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  25.73 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.78 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  28.86 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  26.56 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>