211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2249 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  64.71 
 
 		 277 aa  343  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  62.87 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  49.82 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  50.36 
 
 		 276 aa  261  6e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  53.18 
 
 		 298 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  48.88 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  39.18 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  34.02 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  37.06 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  30.54 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  30.43 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  32.07 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.57 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  30.43 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  32.14 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  29.89 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.98 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  29.89 
 
 		 234 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  33.33 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.54 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31.2 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  31.18 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  32.8 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  30.05 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  30.48 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  29.47 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  27.31 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.34 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.57 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.95 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  29.73 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  32.35 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  24.79 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  34.33 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  29.1 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.89 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.57 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  25.91 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.57 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  28.69 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.44 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  33.17 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.44 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  31.44 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  29.84 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  25.93 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.91 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  37.59 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  31.98 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  28.92 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.82 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  36.09 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  26.18 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.41 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.69 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  28.64 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  31.47 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.84 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  27.8 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  26.05 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.84 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  26.05 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  34.68 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  27.14 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  27.14 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  27.14 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  27.32 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  28.26 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.96 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.87 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  25.52 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  29 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  35.48 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  32.64 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.33 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.41 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  32.63 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  26.42 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  28.43 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  26.32 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.76 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  31.58 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.04 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.68 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  31.85 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  32.64 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  31.39 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  32.64 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  25.63 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.67 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>