241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1337 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  100 
 
 
234 aa  477  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  63.04 
 
 
244 aa  265  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  62.45 
 
 
245 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  49.11 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  48.73 
 
 
241 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  43.48 
 
 
240 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  43.93 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  45.57 
 
 
243 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  42.11 
 
 
239 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  40 
 
 
231 aa  168  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  42.48 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  40.69 
 
 
239 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  42.01 
 
 
237 aa  158  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  44.04 
 
 
237 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  44.33 
 
 
237 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  41.92 
 
 
244 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  41.03 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  41.21 
 
 
258 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  42.67 
 
 
227 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  42.24 
 
 
227 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  44.56 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  35.65 
 
 
270 aa  125  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  36.84 
 
 
245 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  36.36 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  37.99 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  37.31 
 
 
241 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  36.92 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  39.06 
 
 
243 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  33.73 
 
 
276 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  32.2 
 
 
256 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  31.2 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  38.14 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.76 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  38.46 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  32.75 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  30.9 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  30.47 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  30.9 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.71 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  34.47 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.83 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.83 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.83 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  29.49 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  29.28 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  30.7 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.82 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.14 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  37.69 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.18 
 
 
271 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.78 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  31.34 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  31.34 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.25 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.65 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.38 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.05 
 
 
298 aa  78.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.14 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  32.69 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  31.82 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  30.77 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.09 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  32.65 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  32.14 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  25.86 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  31.03 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.2 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.76 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  33.05 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.81 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  30.81 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  28.4 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  31.86 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  30.67 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.64 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.83 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  30.51 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.87 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.22 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  26.36 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.72 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  24.9 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.53 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.38 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  26.39 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>