155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4797 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  57.63 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  56.43 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  54.36 
 
 		 245 aa  241  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  52.52 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  56.73 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  50.83 
 
 		 256 aa  223  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  49.79 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  53.52 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  52.61 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  47.72 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  51.94 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  46.19 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  40.17 
 
 		 423 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  45.81 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  48.47 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  39.75 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  41.81 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  39.27 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  40.49 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  37.99 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  36.17 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  36.86 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  35.68 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  34.02 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.07 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  39.79 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.39 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.98 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.45 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  38.34 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  41.13 
 
 		 270 aa  97.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  34.91 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  35.48 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.96 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  32.16 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  32.09 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.81 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  32.5 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.92 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.5 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  29.71 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25.11 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  31.1 
 
 		 923 aa  62.4  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.79 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  32.06 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.7 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  28.49 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.57 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  32.06 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  28.63 
 
 		 1071 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.86 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.98 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.71 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.99 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.26 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.26 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.57 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  26.32 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  30.6 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  34.62 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  28.79 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  33.33 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.04 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.41 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.36 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  25.12 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.99 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.34 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  32.52 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.06 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  32.63 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.55 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.64 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  28.83 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  32.35 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  30.2 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.37 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  32.02 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.56 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.86 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.86 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  23.45 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  23.45 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  23.45 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  32.63 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  31.34 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  33.08 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  23.45 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  23.45 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.63 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  27.72 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  27.72 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  30.77 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  23.89 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  28.26 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.45 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.74 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  34.15 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>