72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04810 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 
923 aa  1843    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  38.74 
 
 
1071 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  31.93 
 
 
833 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  35.2 
 
 
839 aa  107  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  33.92 
 
 
825 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  30.86 
 
 
811 aa  104  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  28.47 
 
 
882 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  32.95 
 
 
826 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  33.88 
 
 
797 aa  94.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  35.15 
 
 
830 aa  91.3  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  29.61 
 
 
843 aa  84.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  33.12 
 
 
930 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  36.09 
 
 
768 aa  71.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  31.87 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.78 
 
 
311 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.89 
 
 
304 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  30.96 
 
 
281 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.51 
 
 
239 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.39 
 
 
323 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  27.75 
 
 
288 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  30.36 
 
 
245 aa  55.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  30.51 
 
 
246 aa  55.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  29.21 
 
 
243 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.8 
 
 
259 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  29.14 
 
 
240 aa  54.3  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  31.49 
 
 
293 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  31.61 
 
 
296 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  31.32 
 
 
239 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  32.54 
 
 
243 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.59 
 
 
243 aa  52.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.67 
 
 
231 aa  52.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  30.46 
 
 
244 aa  52  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  31.25 
 
 
241 aa  51.6  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  28.66 
 
 
239 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  27.37 
 
 
258 aa  51.2  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  29 
 
 
359 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  29.21 
 
 
242 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.32 
 
 
238 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.82 
 
 
218 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  27.45 
 
 
305 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  27.59 
 
 
1275 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  29.76 
 
 
245 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  29.94 
 
 
314 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  29.67 
 
 
237 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  26.51 
 
 
245 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  26.79 
 
 
237 aa  48.5  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  27.68 
 
 
298 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.47 
 
 
238 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  25.27 
 
 
1247 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  24.03 
 
 
303 aa  47.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.76 
 
 
270 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.27 
 
 
1585 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.27 
 
 
1474 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  24.91 
 
 
1002 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  27.01 
 
 
300 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  28.9 
 
 
307 aa  46.2  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.76 
 
 
288 aa  46.2  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.27 
 
 
1217 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  24.8 
 
 
1020 aa  46.2  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  25.6 
 
 
237 aa  45.8  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.86 
 
 
238 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  28.85 
 
 
361 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.39 
 
 
234 aa  45.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  27.33 
 
 
213 aa  45.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  27.71 
 
 
240 aa  45.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.2 
 
 
244 aa  45.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.66 
 
 
2286 aa  45.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  25.6 
 
 
237 aa  45.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  26.91 
 
 
302 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  28.4 
 
 
294 aa  45.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29.34 
 
 
260 aa  44.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  32.65 
 
 
245 aa  44.3  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>