148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2878 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  56.02 
 
 		 245 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  56.84 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  53.28 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  51.22 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  52.32 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  53.81 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  53.52 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  51.26 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  45.02 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  48.8 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  45.34 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  38.24 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  38.33 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  40.5 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.62 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  40.1 
 
 		 423 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  47.37 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  38.53 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.7 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  34.91 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  37.14 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  36.6 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  33.91 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  32.75 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.87 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  30.68 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  33.05 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  33.77 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.6 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  33.12 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.47 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.87 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  34.59 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  36.79 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  36.36 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  34.46 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  40.74 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.46 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  31.05 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  34.38 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.32 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.07 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  31.03 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  35.92 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  30.67 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.26 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  28.12 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  33.6 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.71 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  32.4 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  30.51 
 
 		 923 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.63 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  30.66 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  29.46 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  32.58 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.19 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  33.82 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  31.11 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  33.33 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.4 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  31.93 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  33.08 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  28.57 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  33.06 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  30.4 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  35.9 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  34.62 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.33 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  32.14 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  28.95 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.86 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  33.77 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  33.33 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  29.37 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29.7 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  26.06 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  30.58 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  33.33 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  32.59 
 
 		 471 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  31.67 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  27.27 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.15 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  35.64 
 
 		 462 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  31.25 
 
 		 930 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  24.7 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  24.18 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.95 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  25.54 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  30.83 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  40.23 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  31.67 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  32.88 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.21 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  32.59 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  30.33 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  30.59 
 
 		 797 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>