150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3452 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  57.63 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  58.53 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  57.92 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  60.47 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  50.68 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  52.61 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  51.43 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  48.8 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  47.66 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  45.96 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  48.46 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  44.44 
 
 		 423 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  48.46 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  46.36 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.8 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  38.46 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  37.81 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  37.86 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  37.86 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  31.86 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.16 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  36.11 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  39.74 
 
 		 259 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  39.74 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  35.53 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  31.86 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  34.31 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.42 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.96 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.96 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  35.03 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  34.62 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  33.94 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.78 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  27.78 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.09 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  31.09 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.5 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  34.9 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.05 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  33.33 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  35.45 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  38.17 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.11 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.14 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  34.88 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  25.96 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  35.29 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  41.67 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.69 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  36.44 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.88 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  33.33 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.39 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  25.82 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  25.96 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  34.26 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.53 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  30.91 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.83 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  27.34 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.26 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  30.91 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  35.64 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.47 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  30.36 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  29.34 
 
 		 923 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.91 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  34.31 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  36.3 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  27.35 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26.8 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  32.35 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  36.63 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  34.55 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  36.63 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  26.69 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  30.1 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  37.18 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  33.02 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.53 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.53 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.87 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  34.18 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  33.02 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  26.76 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  33.64 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.59 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  32.73 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.71 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  35.1 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  33.57 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  25.13 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  33.04 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  33.04 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  33.04 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>