235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1258 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  100 
 
 
234 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  90.17 
 
 
234 aa  450  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  88.89 
 
 
234 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  447  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  89.32 
 
 
234 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  63.04 
 
 
236 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  59.03 
 
 
236 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  40.71 
 
 
242 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  37.5 
 
 
237 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  39.22 
 
 
238 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  38.82 
 
 
238 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  38.43 
 
 
243 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  38.05 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  36.49 
 
 
249 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  36.28 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  35.59 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  34.65 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.48 
 
 
245 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  34.38 
 
 
250 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  34.07 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  31.62 
 
 
243 aa  138  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  34.5 
 
 
239 aa  138  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  30.7 
 
 
270 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  34.91 
 
 
242 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  36.07 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  34.23 
 
 
248 aa  131  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  33.63 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  33.19 
 
 
251 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  35.81 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  36.22 
 
 
261 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.33 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  31.72 
 
 
298 aa  95.5  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  33.19 
 
 
240 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  32.76 
 
 
221 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.47 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.76 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.89 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.89 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.84 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.47 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  32.26 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  32.07 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  28.57 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  32.42 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  31.03 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.06 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.7 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  30.33 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.54 
 
 
241 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.75 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.77 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  31.33 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  29.32 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  29.82 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.8 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  31.12 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  30.73 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.03 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  30.43 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.88 
 
 
271 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  28.88 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.13 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  27.93 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.45 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  30.62 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.31 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  29.85 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.65 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  29.53 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  24.03 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  27.19 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  26.82 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  26.63 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  27.14 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.19 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  30.22 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.27 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  26.43 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.9 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.49 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  29.02 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.35 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  27 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  28.32 
 
 
350 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.35 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.06 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.89 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.06 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  27.06 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  27.35 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  25.55 
 
 
221 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.15 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  32.39 
 
 
358 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  26.34 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>