181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3596 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.8 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  37.66 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  33.63 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  34.07 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  33.19 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.3 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.3 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  36.32 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.72 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  36.67 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  35.5 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  36.48 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  36.36 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  34.48 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  38.64 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  36.24 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  35.1 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  33.47 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  36.04 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  31.36 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  35.47 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  33.05 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  31.91 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  30.26 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  31.62 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  32.6 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  31.56 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  32.34 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  32.43 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  33.19 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  32.91 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  34.68 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  29.78 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.43 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.94 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.69 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.32 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.35 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.18 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  26.98 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  26.76 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.04 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.29 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.26 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.65 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  28.65 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  27.23 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  27.23 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.9 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.1 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.88 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.8 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  26.27 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  27.95 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  25.21 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  27.59 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  27.49 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  30.77 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28.87 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  29.79 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.8 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.64 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  29.35 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  26.41 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  31.58 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  36.15 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  35.83 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.14 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.8 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.21 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  25.63 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  28.28 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  31 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  26.67 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.82 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25.89 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.41 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23.08 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  28 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  24.88 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.65 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  23.32 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  24.77 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.19 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.96 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.49 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  27.75 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  29.85 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.11 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>