197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0661 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  53.36 
 
 		 223 aa  247  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  54.91 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  48.18 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  48.18 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  47.77 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  46.4 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  46.43 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  44.54 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  45.05 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  38.07 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  40.37 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  40.99 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  41.67 
 
 		 569 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  40.54 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  37.16 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  35.59 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  36.07 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  29.49 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  33.78 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  29.49 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  34.7 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.7 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  29.07 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.04 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.96 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  29.28 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  28.81 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  30.84 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.96 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  29.96 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.96 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  28.37 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  32.04 
 
 		 358 aa  78.2  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  31.49 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  27.39 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.1 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  30.04 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  29.44 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.51 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.43 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.43 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.82 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.71 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.75 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.51 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  28.77 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  31.9 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  30.53 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.94 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.64 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.9 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  27.12 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.27 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.67 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.72 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  27.55 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.84 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  25.32 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.09 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  28.12 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.89 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  23.5 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  27.12 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.94 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  24.68 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  28.45 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  28.45 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  29.95 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  26.5 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  23.53 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  35.85 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  24.02 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.06 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.82 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  32.82 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  29.87 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.58 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  28.87 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  25.3 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  32.28 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  42.67 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  28.91 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  32.82 
 
 		 447 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  26.01 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.39 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  29.55 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  24.75 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  26.24 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  30.14 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  37.08 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>