136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3660 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  66.39 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  64.08 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  62.7 
 
 		 245 aa  284  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  52.48 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  45.08 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  46.69 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  44.26 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  41.8 
 
 		 447 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  36.32 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  36.82 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  31.25 
 
 		 260 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  38.36 
 
 		 462 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  35.56 
 
 		 292 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  30.63 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  29.07 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  36.53 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  30.73 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  33.75 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  33.06 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  38.18 
 
 		 464 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  32.9 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.56 
 
 		 193 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  34.82 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  34.56 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  30.97 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  34.56 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  34.39 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  33.19 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  38.67 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  29.61 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.59 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  32.68 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  32.3 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  30.13 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  25.26 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.64 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  32.29 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  34.19 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  27.45 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  31.71 
 
 		 427 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  32.32 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  44.44 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.94 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.5 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.43 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.15 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  32.62 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.5 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  20.4 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  40.86 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  36.17 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  33.15 
 
 		 708 aa  55.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  23.81 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.88 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  32.47 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.5 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  35.71 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  24.61 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  37.8 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  34.52 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  42.53 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.86 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.27 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.79 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  28.12 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  24.88 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  36.73 
 
 		 469 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.8 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  29.27 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.73 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  26.87 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.76 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  24.3 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.13 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  28.51 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  40 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  28.79 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23.81 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  25.62 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  25.62 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  39.8 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  26.88 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  24.63 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  24.63 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  21.13 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  29.23 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  31.21 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  30.48 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  23.67 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  25.67 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  25.25 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  25.25 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  40 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  31.33 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  40.23 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>