53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2689 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  41.48 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  41.43 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  41.59 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1078  LmbE family protein  41.48 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0142184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1075  LmbE family protein  41.67 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  40.85 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  31.4 
 
 		 262 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.4 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  28.63 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  29.59 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  28.81 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  28.48 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  27.33 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  24.11 
 
 		 693 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  28.14 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  26.58 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  28.47 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  35.48 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  28.09 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  28.65 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.23 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.3 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.85 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  24.87 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.47 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  27.74 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.81 
 
 		 217 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.74 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  30.1 
 
 		 464 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  27.61 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  27.61 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  22.22 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.1 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.99 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.1 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  30.15 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  29.15 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.12 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.36 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.52 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  29.37 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  28.7 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  29.78 
 
 		 271 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>