220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1918 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  38.55 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  40.11 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  37.44 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  36.06 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  38.65 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  35.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.1 
 
 		 223 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  32.71 
 
 		 223 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  34.85 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  31.82 
 
 		 227 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  34.62 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  33.18 
 
 		 223 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  35.15 
 
 		 203 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32.16 
 
 		 225 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  32.88 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  31.34 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.96 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  29.49 
 
 		 222 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  33 
 
 		 208 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  30.92 
 
 		 209 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  30.84 
 
 		 218 aa  95.9  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  31.25 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  28.05 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  31.02 
 
 		 209 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  31.9 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  28.32 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.26 
 
 		 239 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  30 
 
 		 221 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  31.9 
 
 		 218 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  29.82 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  31.43 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.02 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  26.15 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.31 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  27.52 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  28.37 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.31 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  30.22 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  28.14 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  27.6 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  27.36 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  32.28 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.69 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  29.06 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  25.93 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.75 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  27.65 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  31.43 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  29.05 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  24.22 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  26.67 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.34 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  31.03 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  29.67 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.89 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  23.93 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.89 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.84 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  29.19 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  26.03 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  26 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  28.18 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  31.15 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  34.71 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  31.17 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  26.57 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.42 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  24.77 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  25.73 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  35.25 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  29.5 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  31.15 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.43 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.61 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  26.34 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  28.26 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  23.83 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  31.36 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.49 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  28.79 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  28.19 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.09 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  26.32 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  22.46 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  27.47 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.18 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.27 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  26.26 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>