69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0440 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  99.54 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  87.16 
 
 		 218 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  52.8 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  52 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  46.73 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  43.96 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  45.45 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  45.5 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  41.26 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  31.43 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  28.3 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.12 
 
 		 308 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  26.79 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.7 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.55 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.47 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.47 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.47 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 359 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  24.45 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  22.87 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  30.58 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  30.05 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  36.44 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  33.61 
 
 		 358 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  30.77 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  25.43 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.58 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  33.9 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  35.65 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  31.06 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  24.29 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  30.58 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  31.97 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  28.09 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  25.58 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.32 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  29.41 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  42.37 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  30.33 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  31.15 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  30.58 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  29.49 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  28.46 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.25 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  25.98 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  24.55 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.84 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.57 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  30.14 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.83 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.15 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  32.81 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  28 
 
 		 227 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.97 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  30.43 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  28.69 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  47.5 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  31.25 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>