65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3392 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  100 
 
 		 218 aa  453  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  87.61 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  87.16 
 
 		 218 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  53.2 
 
 		 208 aa  215  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  50.7 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  44.55 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  42.23 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  45 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  42.65 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  40.5 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  31.9 
 
 		 302 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  27.83 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.63 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  26.32 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.67 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  34.09 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 359 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  23.4 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.52 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.97 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.97 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  22.07 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.75 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  26.83 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.73 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  29.17 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.46 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  27.23 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  38.46 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  31.93 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.5 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  26.8 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  27.2 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.48 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25.75 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  23.04 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  28.39 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  25.23 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  27.71 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  28.68 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.71 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.14 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  26.15 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  25.11 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  27.2 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  28.11 
 
 		 358 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.37 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  22.82 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.87 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  22.46 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.46 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  22.5 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.46 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  27.39 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>