111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5396 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  66.67 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  29.26 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  34.91 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.35 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  32.64 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  31.17 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.15 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  28.15 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.81 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  27.9 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32.5 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.49 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  30.21 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  29.24 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  25 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  30.77 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  31.91 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.19 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  27.54 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.22 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  28.32 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  27.31 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  31.94 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  23.14 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  28.03 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  31.29 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  28.31 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  30.54 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.03 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  27.38 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  31.51 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  27.6 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  28.57 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  27.35 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  62.5 
 
 		 693 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  23.61 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.51 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  25.47 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  27.54 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  29.27 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.56 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  24.44 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.56 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.02 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  27.75 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.02 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  23.55 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  28 
 
 		 447 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.5 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.69 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  40.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  36.67 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.49 
 
 		 308 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  42.37 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.36 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.5 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  23.14 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.58 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  53.66 
 
 		 124 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  53.85 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  25.85 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  39.13 
 
 		 487 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  51.28 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  31.58 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  50 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 642 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  26.15 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  24.12 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  55.26 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.55 
 
 		 464 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  51.35 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  26.29 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  41.38 
 
 		 471 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  22.97 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.24 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  27.72 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  36.07 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  50 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  34.55 
 
 		 670 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  34.55 
 
 		 642 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  38.78 
 
 		 469 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  51.28 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  26.14 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.64 
 
 		 642 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  42.55 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  44.68 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  42.55 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  52.63 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>