277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2122 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  71.05 
 
 		 236 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  63.04 
 
 		 234 aa  318  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  61.74 
 
 		 234 aa  311  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  60.87 
 
 		 234 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  61.3 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  61.3 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  41.18 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  39.83 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  40.25 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  38.7 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  42.54 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  39.83 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  35.29 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  34.33 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  37.02 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  37.18 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  39.65 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  37.44 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  36.36 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  35.32 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  37.02 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  40.25 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  37.28 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  37.77 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  34.48 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  35.4 
 
 		 248 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  35.54 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  37.27 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  38.14 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  33.33 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.8 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  33.52 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  31.08 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.98 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.8 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  31.17 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  33.06 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  31.3 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  32.74 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  33.05 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  32.33 
 
 		 261 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.5 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  33.06 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  29.38 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.85 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.58 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.38 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  32.39 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  32.64 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.44 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.47 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  30.53 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  32.2 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  30.57 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  31.05 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  26.73 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  29.48 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.69 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.32 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.41 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.41 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  27.78 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  28.57 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.29 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  30.37 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  28.03 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  28.82 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  26.09 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.03 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  29.69 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.46 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.65 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.09 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.03 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  28.07 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.03 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.03 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  27.03 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.03 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  25.33 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.74 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  31.28 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.78 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.36 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.63 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  32.4 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.96 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.49 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.37 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>