171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0232 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  73.42 
 
 		 238 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  69.62 
 
 		 238 aa  351  7e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  53.16 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  54.81 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  50.84 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  53.97 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  48.74 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  43.04 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  42.8 
 
 		 249 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  43.88 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  42.41 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  44.93 
 
 		 266 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  40.43 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  42.31 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  39.83 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  37.78 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  37.78 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  39.65 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  38.05 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  36.89 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  34.18 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  38.2 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  31.25 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  32.43 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.36 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  31.15 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  31.41 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.77 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.79 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.78 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.63 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.39 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  30.73 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.05 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.57 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  29.38 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  29.69 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.26 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.81 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.63 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.26 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  26.69 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  28.19 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  28.94 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.19 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.79 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  26.18 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  29.02 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  27.75 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.95 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  26.86 
 
 		 569 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  35.25 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  28.04 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  27.14 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.11 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  26.67 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  29.49 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.53 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  25.97 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  25.62 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  27.6 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  27.98 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  30.25 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  27.94 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  28.33 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.12 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.52 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  33.68 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  25.98 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  28.51 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  27.32 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  25.97 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.72 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  25.1 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  26.84 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  24.62 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  28.64 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.83 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.19 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  32.67 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  26.61 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  32.04 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  27.85 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23.95 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.96 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.96 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>