167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1971 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  46.34 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  45.99 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.37 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  27.6 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.38 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  31.06 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  26.39 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.95 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  26 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  30.54 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.72 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  30.86 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  27.14 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  30.36 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  25.79 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  30.97 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  33.74 
 
 		 298 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  34.03 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  24.1 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.16 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  31.82 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  34.19 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  31.9 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  26.69 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  29.44 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  32.14 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  31.85 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  24.59 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.49 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.53 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  32.69 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.8 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  28.57 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  26.22 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  25.71 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  25.93 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  24.77 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.17 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  30.14 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  31.16 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  28.78 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  29.88 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  33.73 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  31.75 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  29.45 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  27.27 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  29.85 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  31.17 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.97 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  27.97 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  27.98 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  28.57 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  27.49 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  28.48 
 
 		 299 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.97 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  30.72 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  30.13 
 
 		 303 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  28.99 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.14 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  26.8 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  30.22 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  33.79 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  30.22 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  30.22 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  27.52 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.8 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  28.48 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  29.85 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.81 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.3 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  65 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  33.13 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  32.28 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  30.19 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25.97 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  30.71 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  26.59 
 
 		 312 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.39 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.53 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  27.38 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.53 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  27.7 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  27.7 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  28.17 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  25.9 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  24.21 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  21.6 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  32.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  27.52 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  27.73 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.54 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  29.25 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>