61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3950 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  80.18 
 
 		 217 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  46.73 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  45 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  43.96 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  43.96 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  42.23 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  41.55 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  39.71 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  37.68 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  32.67 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  30.59 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.09 
 
 		 308 aa  74.7  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.67 
 
 		 302 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  25.96 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.84 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.84 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  28.84 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.84 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  32.16 
 
 		 358 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  31.71 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  28.33 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.37 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  32 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  28.44 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.68 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.97 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  27.27 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.37 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  26.34 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.48 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  28.16 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.09 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  29.15 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  31.71 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  31.58 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.12 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.56 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  29.51 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.16 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.45 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  29.75 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  26.22 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  25.76 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  27.36 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  25.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  29.14 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.22 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.09 
 
 		 234 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  22.94 
 
 		 209 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  28.31 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>