139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0168 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  495  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  66.67 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  33.62 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  33.33 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  32.35 
 
 		 223 aa  99  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  28.27 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.57 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  32.19 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.47 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  27.9 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  27.66 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.47 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  26.41 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  30.54 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  26.46 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  28.76 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.09 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  28.88 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  28.75 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.81 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  29.63 
 
 		 258 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  25 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  30.69 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  29.22 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  26.61 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  28.09 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  32.19 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  31.69 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  26.07 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  31.82 
 
 		 447 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.31 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  27.23 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.1 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  27.06 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.47 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  24.47 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  26.45 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25.9 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  26.38 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  27.35 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  59.09 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  25.61 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.75 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  27.78 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  25 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  28.88 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  23.73 
 
 		 569 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  57.5 
 
 		 693 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.89 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  31.65 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  24.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  40 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  35.29 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  25.31 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  28.57 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.89 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.85 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  22.65 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  32.82 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  35 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  25.43 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.89 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.56 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  23.56 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.56 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  31.71 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  25.43 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  25.32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  27.23 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  26.42 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  23.23 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  46.15 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  30 
 
 		 464 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  38.98 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.04 
 
 		 637 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  26.41 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  50 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  46.34 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  33.61 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  25.23 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.64 
 
 		 646 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.64 
 
 		 657 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  46.34 
 
 		 124 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  45.95 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  32.47 
 
 		 277 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  36.36 
 
 		 642 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  23.19 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>