228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0661 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  100 
 
 		 239 aa  493  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  57.14 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  55 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  55.04 
 
 		 238 aa  278  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  52.3 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  51.05 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  50.84 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  49.58 
 
 		 243 aa  247  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  46.69 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  43.46 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  44.49 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  43.88 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  41.53 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  41.18 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  41.6 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  45.54 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  40.34 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.56 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  36.36 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  34.89 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  34.5 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  32.23 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  33.04 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  31.36 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  35.62 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  32.02 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  35.07 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  30.04 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  30.08 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.12 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  32.81 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.5 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.53 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  29.27 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  30.22 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.9 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  30.13 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.37 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.69 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.84 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  31.63 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.05 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.95 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  24.79 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.42 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  28.83 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.71 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  24.24 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.5 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.86 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  26.52 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.86 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  31.31 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.27 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  25.33 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.5 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  29.91 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  26.29 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  29.91 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  27.07 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.62 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  30.69 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  24.9 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30.53 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.23 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  26.81 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  27.67 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  25.63 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  33.83 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  25.77 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  30.85 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  27.37 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  31.16 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.23 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  30.56 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  25.52 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24.24 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  32.89 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.81 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  25.26 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  23.91 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.27 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.81 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  26.81 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  27.7 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  23.48 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  29.76 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.05 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>