123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 		 234 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  36.96 
 
 		 277 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  39.06 
 
 		 471 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  38.34 
 
 		 462 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  36.68 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  38.22 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  36.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  32.09 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  34.26 
 
 		 427 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  31.63 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  29.13 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  36.88 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  32.57 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  37.02 
 
 		 708 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  25.67 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.24 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  29.19 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  33.16 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  35.1 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.66 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  31.47 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  39.61 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  37.69 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  30.95 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  30.25 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  26.15 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  28.89 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  32.85 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  29.68 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  23.44 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  27.5 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  29.35 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  24.18 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  32.26 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  29.59 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  32.26 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  32.37 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  30.15 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  37.69 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.98 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  31.6 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.04 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  30.77 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.47 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  36.92 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.85 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  28.47 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  30.96 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  29.63 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  33.17 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.85 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  34.17 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.88 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.15 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  30.92 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.89 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.41 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  19.37 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.89 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  33.16 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  36.84 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  35.29 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  25.9 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  25.9 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  22.87 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.8 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.14 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  23.79 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.35 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  27.93 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  28 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  31.93 
 
 		 423 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  31.66 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.35 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  37.93 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.32 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  25.52 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  20.61 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.41 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.35 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.7 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.54 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>