129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0239 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  43.48 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  37.44 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  34.48 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  32.67 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  31.34 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.64 
 
 		 308 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  30.54 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  31.48 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.5 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  25.82 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  30.58 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  30.58 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  30.58 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  30.58 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  28.57 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  30.1 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  29.81 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  28.43 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  27.93 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  28.57 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  26.32 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.85 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  26.79 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  26.57 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  25 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  29.21 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  29.21 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  29.21 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  29.21 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  29.21 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.65 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  29.53 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.65 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.98 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  26.07 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  26.73 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  28.32 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  26.96 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.04 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.09 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  26.21 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.07 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.53 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  24.88 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  27.93 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.12 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  26.4 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  28.41 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  30.7 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  23.08 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  25.85 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  25.11 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  24.77 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  22.77 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  26.79 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  25.5 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.61 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  26.11 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  25 
 
 		 358 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  26.47 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  25.11 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  25.22 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  30.17 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24.27 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  24.75 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  30.43 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  24.62 
 
 		 265 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  31.62 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.41 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  24.11 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.79 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  33.01 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  31.86 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.11 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  25.93 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  29.03 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  25.54 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  24.12 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  26.92 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  24.23 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  27.12 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.26 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  25.98 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  27.2 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  22.28 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  21.23 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  23.75 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  25.33 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  32.1 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  23.16 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  20.61 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  23.91 
 
 		 254 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  22.57 
 
 		 253 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  24.32 
 
 		 236 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  26.85 
 
 		 471 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  27.78 
 
 		 447 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>