28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2284 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  100 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  67.9 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  67.5 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  67.08 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  66 
 
 		 252 aa  291  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  55.42 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  54.78 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  35.42 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  33.05 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  32.79 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  40.83 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  33.62 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  31.42 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  31.42 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.11 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  32.43 
 
 		 338 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  29.25 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.11 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  27.31 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  24.02 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  29.2 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  21.79 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  24.32 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  27.43 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  30.14 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  34.01 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  33.56 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  26.7 
 
 		 234 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>