28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2182 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  39.24 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  36.71 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  31.6 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  31.6 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  31.03 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  30.74 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  29.15 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  34.78 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  36.97 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  32.26 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  29.37 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  35.95 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  35.95 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  37.42 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  27.49 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  35.62 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  35.62 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  35.62 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  35.62 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  35.62 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  36.05 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  36.05 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  29.2 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  36.56 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  28.09 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  30.97 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  29.44 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>