26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6391 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  94.89 
 
 		 235 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  77.92 
 
 		 231 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  74.89 
 
 		 231 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  74.89 
 
 		 231 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  72.77 
 
 		 231 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  61.9 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  61.47 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  44.12 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  41.2 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  38.26 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  39.64 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  39.64 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  34.98 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  29.6 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  27.83 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  26.92 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  44.83 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  29.46 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  32.89 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>