30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1018 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  52.42 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  53.82 
 
 		 254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  53.51 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  51.98 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  50.41 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  56.65 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  34.39 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  44.64 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  35.47 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  33.2 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  32.93 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  26.07 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.91 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  32.1 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  26.51 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  25.65 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  23.65 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  32 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.96 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  30.77 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  32.89 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  34.42 
 
 		 338 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  36.56 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  19.62 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  32.1 
 
 		 670 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  35.23 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  40.24 
 
 		 241 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  33.8 
 
 		 642 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  37.93 
 
 		 244 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>