22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3367 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  477  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  44.64 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  36.52 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  36.78 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  34.84 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  40.83 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  38.01 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  33.7 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.73 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  30.56 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  35.75 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  29.28 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  23.5 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  29.72 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  29.72 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.64 
 
 		 642 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.61 
 
 		 271 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.64 
 
 		 670 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>