244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1304 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  44.78 
 
 		 193 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  29.22 
 
 		 244 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  29.96 
 
 		 300 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  32.18 
 
 		 288 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  34.69 
 
 		 302 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.35 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.36 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.36 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30.85 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  31.86 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  28.5 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  32.24 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  27.75 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  27.8 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  33.07 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  30.35 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  30.35 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  30.35 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  30.28 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  28.11 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.98 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30.65 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  28.9 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  27.06 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  32.46 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  26.96 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  28.44 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.94 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  28.9 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  29.19 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  29.19 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.67 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  29.47 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.84 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.14 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.78 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  27.81 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  28.42 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.08 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  26.88 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  30.81 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.12 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  29.38 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  31.25 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.25 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  25.4 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30.26 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  25.93 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  33.08 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.9 
 
 		 469 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  25.86 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  24.37 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  25.2 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.02 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.02 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  25.93 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.02 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  29.03 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  27.04 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.24 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  26.72 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.36 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  25.88 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  27.64 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  29.17 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.28 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.73 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.32 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 		 492 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  29.07 
 
 		 337 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.8 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.8 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  24.34 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.98 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  24.74 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  26.27 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  28.4 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.48 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  26.53 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.35 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  28.35 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.58 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.91 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25.52 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  23.2 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  29.53 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  26.9 
 
 		 693 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  32.37 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  30.43 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.32 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  23.51 
 
 		 487 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  26.49 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>