225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2816 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  58.82 
 
 
274 aa  320  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  55.76 
 
 
299 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  43.49 
 
 
260 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  35.74 
 
 
304 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  32.51 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  43 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  34.02 
 
 
314 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.51 
 
 
309 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  39 
 
 
311 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  35.19 
 
 
292 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  32.6 
 
 
286 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  34.29 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.72 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  33.44 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  31.71 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.39 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.19 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  37.22 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.48 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.6 
 
 
361 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  31.69 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  30.15 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.61 
 
 
294 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.33 
 
 
268 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  31.27 
 
 
276 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  31.58 
 
 
302 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.1 
 
 
484 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  32.12 
 
 
308 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  32.12 
 
 
308 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  32.12 
 
 
308 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.69 
 
 
323 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  35.78 
 
 
238 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  30.33 
 
 
307 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  30.79 
 
 
314 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  33.33 
 
 
271 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  38.78 
 
 
303 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30.47 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  29.97 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  29.87 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  41.38 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  29.45 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  29.1 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  29.1 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  29.1 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  31.12 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  32.27 
 
 
302 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.46 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  30.24 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  35.78 
 
 
263 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  33.64 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  31.02 
 
 
295 aa  89  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.13 
 
 
355 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.33 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  31.22 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30.14 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  29.63 
 
 
293 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.66 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.18 
 
 
227 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  26.9 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  28.28 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  33.48 
 
 
217 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.49 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.18 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  30.58 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.18 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.49 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  31.63 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  29.65 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.15 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  34.24 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  29.96 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  28.47 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  28.52 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  28.77 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.91 
 
 
220 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  30.72 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  34.84 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  26.72 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  27.18 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  36.14 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.33 
 
 
227 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  33.52 
 
 
369 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  28.14 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4210  LmbE family protein  44.37 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.63 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  28.63 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  28.63 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  27.96 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  29.7 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.63 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.47 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  27.92 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  34.81 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>